A seguito della sopravvenuta legge n.218/90, essa ha assunto il ruolo di “Ente Conferente” rispetto alla Cassa di Risparmio di Puglia, scorporando l’attività creditizia che venne contestualmente attribuita alla “Società per azioni Conferitaria”.
Il 12 Febbraio 2016, la Fondazione ha cambiato la propria denominazione in FONDAZIONE PUGLIA ed ha aggiornato il logo.